Sem atuar pela Macaca em 2025, Mateus está fora dos planos da diretoria desde o rebaixamento à Terceira Divisão, no fim de 2024. No início deste ano, o jogador entrou com uma ação na Justiça do Trabalho de Campinas, cobrando o clube por pendências financeiras. Entre as reivindicações, estavam a falta de pagamentos, cláusula compensatória, 24 meses de FGTS atrasado, além de férias e 13º salários dos anos de 2023 e 2024. Ele também solicitava a rescisão do contrato.

As partes, no entanto, chegaram a um acordo para encerrar o processo. Desde então, o zagueiro voltou a treinar com o elenco, mas não foi mais utilizado em partidas.

Com vínculo até 31 de dezembro de 2025, Mateus Silva chegou à Ponte Preta em 2022, inicialmente por empréstimo do Cruzeiro. Posteriormente, assinou contrato em definitivo com o clube campineiro. No total, o defensor soma 82 jogos e seis gols com a camisa alvinegra.